L’ICTJ existe depuis plus de vingt ans. Au moment de sa création, nombre de ceux qui ont contribué aux transitions en Argentine, au Chili, au Guatemala, en Afrique du Sud et dans l'ex-Yougoslavie ont vu la valeur d'une organisation spécialisée capable de s'appuyer sur diverses expériences nationales pour fournir des conseils d'experts aux groupes de victimes, la société civile, les gouvernements et les acteurs internationaux. Depuis, l’organisation n’a cessé d’évoluer, accumulant une richesse d’expérience et de connaissances et consolidant sa position de leader dans le domaine.